Gostaria de saber como configurar o dropbox pela interface de texto em um Debian, lembrando que essa máquina não tem interface gráfica.

jovem, siga esses passos (de acordo com a arquitetura):

https://www.dropbox.com/install?os=lnx

e baixe isso:

https://www.dropbox.com/download?dl=packages/dropbox.py

se quiser (ou quando tiver) interface gráfica, veja esse artigo:

http://gnu2all.blogspot.com.br/2012/08/dropbox-hospedagem-ou-compartilhamento.html

Bom primeiro de tudo valeu pela dica realmente resolveu meu problema, so gostaria de saber como altero o diretório padrão do Dropbox, alguma ideia ?

Testado e aprovado!

x86.
$ cd
$ wget -c https://dl-web.dropbox.com/u/17/dropbox-lnx.x86-1.4.12.tar.gz
$ tar -zxf dropbox-lnx.x86-1.4.12.tar.gz
$ cd .dropbox-dist/
$ ./dropboxd

amd64.
$ cd
$ wget -c https://dl-web.dropbox.com/u/17/dropbox-lnx.x86_64-1.4.12.tar.gz
$ tar -zxf dropbox-lnx.x86_64-1.4.12.tar.gz
$ cd .dropbox-dist/
$ ./dropboxd

O único problema é que isso 'sobe' é a interface gráfica, e pro seu caso você provavelmente precisa é do script.

É no que posso ajudar.