Softwares para Biólogos no Linux
Uma lista dos softwares que utilizo/utilizei para produção científica nas Ciências Biológicas. No final, uma lista de pequenos softwares que me auxiliam na vida acadêmica de forma mais genérica.
Parte 2: Softwares adicionais
Lógico que um biólogo não vive só de softwares para biologia.
(zotero é um plugin para Firefox com a mesma função, parece estar com o desenvolvimento a todo vapor, mas não me senti bem usando ele... ).
Bibus é software livre que instala através da "Central de Programas" ou (nos Debian-like) do comando mágico:
sudo apt-get install bibus
Para escrita de artigos científicos, eu costumo usar LibreOffice. Infelizmente, não aprendi ainda a usar LaTex... mas, um dia... =)
Edição de imagens com GIMP & LibreOffice Draw (montar pranchas no Draw é moleza).
VIm: tem coisas... que só VIm faz para você...;
Inglês é uma constante para quem lê artigos científicos, então, quando meu vocabulário não dá conta e estou sem acesso à rede, uso GoldenDict com os dicionários do Babylon.
Onde baixar os dicionários:
Preciso frequentemente manipular PDFs, e uso as mais diversas ferramentas para isso, conforme o nível de preguiça ou de necessidade: pdfjam, Pdf-shuffler, tesseract para OCR (reconhecimento óptico de caracteres), todos instaláveis pelo nosso querido:
# sudo apt-get install ...
Exceto R, Ecolog e treeviewx, que apenas instalei, todos os outros já usei de forma mais intensa.
Aos usuários de distros que não utilizam pacotes ".deb", perdão! Não pude testar em outras arquiteturas, e só estou postando aqui o que eu testei pessoalmente.
Adianto apenas que a instalação do ECOLOG será idêntica por ser binário de instalação, e não ".deb".
Bibus
É um pequeno programa para gestão de referências bibliográficas para Linux. Gosto dele pela simplicidade, mas parece que deixou de ser desenvolvido (Bibus exporta, inclusive, para formato HTML e é possível criar um estilo de acordo com ABNT (+ ou -).(zotero é um plugin para Firefox com a mesma função, parece estar com o desenvolvimento a todo vapor, mas não me senti bem usando ele... ).
Bibus é software livre que instala através da "Central de Programas" ou (nos Debian-like) do comando mágico:
sudo apt-get install bibus
Edição de imagens com GIMP & LibreOffice Draw (montar pranchas no Draw é moleza).
VIm: tem coisas... que só VIm faz para você...;
Inglês é uma constante para quem lê artigos científicos, então, quando meu vocabulário não dá conta e estou sem acesso à rede, uso GoldenDict com os dicionários do Babylon.
Onde baixar os dicionários:
Preciso frequentemente manipular PDFs, e uso as mais diversas ferramentas para isso, conforme o nível de preguiça ou de necessidade: pdfjam, Pdf-shuffler, tesseract para OCR (reconhecimento óptico de caracteres), todos instaláveis pelo nosso querido:
# sudo apt-get install ...
Funçõeszz
Funçõeszz do Aurélio Verde são uma mão na roda em muitas circunstâncias na vida acadêmica, recomendo ter sempre instalado:Exceto R, Ecolog e treeviewx, que apenas instalei, todos os outros já usei de forma mais intensa.
Conclusão
Se você conhece algum software útil à produção científica na área de Biologia, que funcione a contento no Linux (e com isso não estou incluindo os softwares que servem para ensinar biologia, que acho que não entra no escopo do artigo), sinta-se livre para comentar e posteriormente acrescento aqui, com a devida autoria.Aos usuários de distros que não utilizam pacotes ".deb", perdão! Não pude testar em outras arquiteturas, e só estou postando aqui o que eu testei pessoalmente.
Adianto apenas que a instalação do ECOLOG será idêntica por ser binário de instalação, e não ".deb".
Que não se compartilha o código e criam projetos colaborativos. Fora licença para uso.
Eu li, mas no momento estou sem a referência.
Isto se traduz em determinado nicho da produção acadêmica e científica.
Gostaria de que alguém esclarecesse em que ponto isto pode soar verdadeiro.
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Encryption works. Properly implemented strong crypto systems are one of the few things that you can rely on. Unfortunately, endpoint security is so terrifically weak that NSA can frequently find ways around it. — Edward Snowden