Usuario logado

Tenho um servidor web/php rodando em linux e preciso saber o nome do usuario logado na estação windows que acessar a aplicação, consegui fazer isso rodando num server windows, mas preciso que rode num linux.

Não sei se entendi muito bem a sua dúvida.

Mas ferramentas de administração de AD para linux você pode utilizar o samba e a partir dele retirar as informações que precisa para sua aplicação.