CSS vs SERVIDOR

Boa noite a todos, estou com um problema que nunca tinha visto antes, e é bem estranho.
Gostaria muito que alguem me ajudasse a entender isso.
Tenho o seguinte codigo que centraliza meu site normalmente:

*{
padding:0;
margin:0;
}

body{
font-family:sans-serif;
}

#site{
width:1200px;
height:720px;
margin:-3px auto;
border:1px solid
#d0d0d0;
}

Enquanto eu o testava no wampserver rodando no win7 funcionava normalmente, no IE e no Firefox.
Depois que movi para o ubuntu server, apenas no firefox fica centralizado, no IE fica na esquerda.
Se o css e interpretado pelo navegador, e o mesmo codigo esta nos dois servidores, por que isso acontece????????
Ja fiquei maluco de tanto pensar, alguem pode me dar uma luz???