Problema na instalação de um software Sfrmtools em ubuntu [RESOLVIDO] [Helps e dicas para usuários iniciantes]

eduardosalviano

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1. Problema na instalação de um software Sfrmtools em ubuntu [RESOLVIDO]

Enviado em 13/06/2020 - 23:52h

Caros,

Trabalho com bioinformática em uma distribuição Ubuntu, atualmente estou tentando trabalhar com um programa que converta arquivos em formato siemens (*.sfrm) obtido em um equipamento do laboratório para o formato que eu possa utilizar (*.cbf). Mas o programa de conversão se mostra um desafio na sua instalação (https://homepage.univie.ac.at/tim.gruene/research/programs/conv/sfrmtools/).

O arquivo disponível para download não possui extensão (https://homepage.univie.ac.at/tim.gruene/research/programs/conv/sfrmtools/downloads/sfrmtools_linux_... ou apt get, e como sou um usuário casual de linux não tenho experiencia nesse tipo de instalação.

Alguém que possa me ajudar nesse caso?

Obrigado pela atenção!

Eduardo

2. Re: Problema na instalação de um software Sfrmtools em ubuntu

Melhor resposta

Enviado em 14/06/2020 - 00:38h

Faça o dowlnoad do binário estático do programa sfrmtools em:
https://homepage.univie.ac.at/tim.gruene/research/programs/conv/sfrmtools/downloads/sfrmtools_linux_...

Pelo Gerenciador de Arquivos, de permissão de execução ao arquivo "sfrmtools_linux_64bit".
Caso o seu Gerenciador de Arquivos não contemple essa funcionalidade, proceda assim:

Abra uma janela de terminal (prompt de comandos) na pasta onde está o arquivo "sfrmtools_linux_64bit".
Digite, ou melhor, cole na janela de terminal, o comando abaixo:
chmod +x 'sfrmtools_linux_64bit'

Para executar o programa, visto que o terminal geralmente é meio burro, pode ser necessário informar o caminho completo até o arquivo sfrmtools_linux_64bit.
Supondo que o arquivo "sfrmtools_linux_64bit" esteja na sua pasta pessoal de Downloads (com D maiúsculo), execute-o da seguinte maneira:
~/Downloads/sfrmtools_linux_64bit
ou com o caminho completo por extenso, por exemplo:
/home/seu_nome_de_usuario/Downloads/sfrmtools_linux_64bit

Corra para a galera.

Olha a figurinha:
https://i.imgur.com/7UR9Bov.png

3. Re: Problema na instalação de um software Sfrmtools em ubuntu [RESOLVIDO]

Enviado em 14/06/2020 - 00:47h

pode ser um executável binário, eu faria isso já de cara.

No terminal eu digitaria:

# ./sfrmtools_linux_64bit

Isso deveria iniciar algo.

Se é um executável binário isso deve funcionar.

___________________________________
Conhecimento não se Leva para o Túmulo.

4. Re: Problema na instalação de um software Sfrmtools em ubuntu

Enviado em 14/06/2020 - 01:47h

mauricio123 escreveu:
pode ser um executável binário, eu faria isso já de cara.
No terminal eu digitaria:
# ./sfrmtools_linux_64bit

- Se não indicar o caminho completo ou simplificado até o arquivo "sfrmtools_linux_64bit", o terminal, mesmo em modo root, não acha o arquivo.
- Se não der permissão de execução ao arquivo, nem root executa (pelo menos no Mint é assim), o usuário declara que usa Ubuntu.

5. Bem explicativo

Enviado em 14/06/2020 - 13:03h

ricardogroetaers escreveu:

Faça o dowlnoad do binário estático do programa sfrmtools em:
https://homepage.univie.ac.at/tim.gruene/research/programs/conv/sfrmtools/downloads/sfrmtools_linux_...

Pelo Gerenciador de Arquivos, de permissão de execução ao arquivo "sfrmtools_linux_64bit".
Caso o seu Gerenciador de Arquivos não contemple essa funcionalidade, proceda assim:

Abra uma uma janela de terminal (prompt de comandos) na pasta onde está o arquivo "sfrmtools_linux_64bit".
Digite, ou melhor, cole na janela de terminal, o comando abaixo:
chmod +x 'sfrmtools_linux_64bit'

Para executar o programa, visto que o terminal geralmente é meio burro, pode ser necessário informar o caminho completo até o arquivo sfrmtools_linux_64bit.
Supondo que o arquivo "sfrmtools_linux_64bit" esteja na sua pasta pessoal de Downloads (com D maiúsculo), execute-o da seguinte maneira:
~/Downloads/sfrmtools_linux_64bit
ou com o caminho completo por extenso, por exemplo:
/home/seu_nome_de_usuario/Downloads/sfrmtools_linux_64bit

Corra para a galera.

Olha a figurinha:
https://i.imgur.com/7UR9Bov.png

Eu tinha baixado em uma subpasta com wget, (Eu estava usando o terminal da distribuição ubuntu do Win10), mas o comando finalmente funcionou quando dei o caminho completo como vc disse, e com ./ como informou a outra resposta tb! Obrigado todos!

Problema na instalação de um software Sfrmtools em ubuntu [RESOLVIDO]

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