Configuração de software

guilhermebdias
(usa Ubuntu)

Enviado em 24/04/2012 - 13:05h

Boa tarde pessoal. Sou um usuário completamente novo do linux. Não sei literalmente nada. Estou com um livro aqui tentando praticar os comandos básicos no shell. Mas eu preciso configurar um programa, e não compreendo bem as instruções do setup. Aqui vão elas:


1.1. Go to 'REPCLASS/conf' folder.
1.2. Open 'repclass.conf' file and make the following modifications:

1.2.1. Configure the '$REPCLASS' entry to the complete location of the REPCLASS folder.
e.g. $REPCLASS = "/home/software/REPCLASS";

1.2.2. Configure the '$BIOPERL' entry to the complete location of the BioPerl directory.
e.g. $BIOPERL = "/usr/bin/perl";

1.2.3. Configure the '$PROGRAMS' entry to the complete location of the EMBOSS suite executables or binaries.
e.g. $PROGRAMS = "/home/software/EMBOSS-6.0.1";

1.2.4. Configure the '$WUBLAST' entry to the complete path of the WU-BLAST directory.
e.g. $WUBLAST = "/home/software/wublast";

1.2.5. Follow the instructions in the 'repclass.conf' file for the other entries, and then proceed to 2. when finished.

Como configurar esse acesso '$REPCLASS' para o local completo do arquivo REPCLASS? Aliás.. o que quer dizer $etcetc "entry"?

BrunoTecnico
(usa Sabayon)

Enviado em 24/04/2012 - 14:25h

Vc precisa nos passar algumas informações á mais.

> Que programa vc está tentando instalar?
> Que linux vc está tentando fazer isso (no Ubuntu mesmo)?

Esse "/home/software/REPCLASS" e "/home/software/EMBOSS-6.0.1", deve ser só exemplo:
Caso contrário vc teria de ter um usuário chamado software .


Se traduzir as instruções, ficará mais fácil pra vc:
http://google.com/translate

removido
(usa Nenhuma)

Enviado em 24/04/2012 - 15:27h

Qual programa ?

guilhermebdias
(usa Ubuntu)

Enviado em 24/04/2012 - 15:44h

O programa que eu quero configurar é o REPCLASS. Um programa de bioinformática.
Esse diretório "software" acredito ser só um exemplo mesmo de local para instalar e configurar o programa.

O programa REPCLASS na verdade usa uma série de outros programas para analisar meus dados, por isso preciso ter estes outros programas instalados nos locais certos (ex. WUBLAST, BIOPERL, RepBase, etc).

Só não entendi essa coisa de "configure $etc entry to the complete location of etc folder."
Eu leio bem em inglês, só não entendi essa instrução. Ele quis dizer "copie" quando diz configure? E o que significa entry? É o meu programa? A pasta descompactada do meu programa?

Obrigado pela disponibilidade pessoal!

guilhermebdias
(usa Ubuntu)

Enviado em 24/04/2012 - 15:44h

Uso Ubuntu mesmo.