CLASSPATH não está configurado com o PATH do Picard

SilviaU
(usa Ubuntu)

Enviado em 07/08/2018 - 23:55h

Oi Pessoal,

Não estou muito familiarizada com o sistema operacional Ubuntu e muito menos com programas de bioinformática muito complexos. Estou tentando rodar o CFSAN SNP pipeline e ele requer diversos complementos/softwares pré instalados na máquina, um deles é o Picard. Este programa roda em Java e pelo que entendi até o momento preciso definir meu JAVA_HOME e outras variáveis como o CLASSPATH dentro do /etc/profile. Após fazer estes passos básicos para configuração do java e de exportar o CLASSPATH + caminho do programa picard.jar para dentro do meu /.bashrc, tentei rodar o pipeline do CFSAN e obtive a seguinte mensagem:

"CLASSPATH is not configured with the path to Picard
Check the SNP Pipeline installation instructions here: http://snp-pipeline.readthedocs.org/en/latest/installation.html";

Já tentei todos tutoriais possíveis para solucionar este problema e não sei mais o que fazer. Alguém pode me ajudar?
Obrigada