Criação de Banco de Dados

Comecei a estudar sobre bancos de dados à pouco tempo, estou usando ferramentas no linux (MySQL Workbench, phpmyadmin, etc...) e no Windows (HeidiSQL, dreamweaver, xampp), para teste de funcionamento nos dois sistemas, então resolvi criar uma espécie de pasta compartilhada para armazenar os bancos de dados em um HD externo, porém quando saio do Windows e entro no Linux o MySQL da um erro:
ERROR 2002 (HY000): Can't connect to local MySQL server through socket '/var/run/mysqld/mysqld.sock' (2);
quando tento usar a "pasta compartilhada" mas quando uso a pasta padrão do mySQL não ocorre nenhum erro.
Já tentei usar o resetar o mysql e o mysql_install_db também retorna erro.

Existe algum meio de compartilhar a pasta do mySQL entre o servidor do Windows e do Linux dessa maneira?
Obs.: Utilizo o servidor do apache desse jeito e não tenho encontrado problemas.

o mysql funciona como um serviço, vc não precisa compartilhar pasta pra acessar os bancos de dados de um servidor, vc só precisa que o serviço esteja levantando, saber o ip do servidor que está rodando o mysql e a porta, a porta padrão do mysql é 3306, e também não pode ter num um firewall bloqueando o acesso ao servidor além de ter a senha do usuário do mysql

o problema é que eu tenho o windows e o linux em dual boot, ou seja, preciso desligar o servidor de um para poder ligar no outro, daí a minha necessidade de criar uma pasta compartilhada...

sinto lhe informar, mas não da pra fazer isso... o que da pra fazer é instalar dois servidores mysql um no windows e outro no linux, mas assim vc não vai conseguir usar o mesmo banco de dados, ou usar um outro banco como por ex, sqlite3 ou firebird pq esses bancos são do tipo arquivo, onde vc vai precisar instalar o servidor e mostrar o caminho do arquivo que vai ser usado.