alekeb
(usa Outra)
Enviado em 11/11/2011 - 15:37h
Olá, já faz algum tempo que deixar a "porta" para trás, e não pretendo voltar. Trabalho em um laboratório de genética e estou tentando instalar o software ARB (http://www.arb-home.de/downloads.html) para analisar sequências de DNA.Baixei um pacote sh e um tgz. o programa só roda se tiver o openmotif instalado, cujo pacote RPM já foi obtido. Durante a instalação, recebi a seguinte instrução:
Follow the steps below with care!!!
******************************************************
add the following lines to your ~/.profile
or to your ~/.bashrc for bash-users
******************************************************
ARBHOME=/usr/arb;export ARBHOME
LD_LIBRARY_PATH=${ARBHOME}/lib:${LD_LIBRARY_PATH}
export LD_LIBRARY_PATH
PATH=${ARBHOME}/bin:${PATH}
export PATH
enter the following command:
. ~/.profile
Note for sysadmins:
In order to provide arb for all users,
edit the global shell init file(s) in /etc
(/etc/bash.bashrc, /etc/csh.cshrc or similar)
in the same manner as described above for the
local shell init files.
Please read the files
/usr/arb/arb_INSTALL.txt
/usr/arb/arb_UBUNTU.txt (if you're using ubuntu)
about additional libraries and tools needed by ARB.
When you installed everything and performed the changes to your init file,
open a new terminal window and start arb by typing
arb
Have much fun using ARB
ARB Team <arb@arb-home.de>
************************************************************************
Não sei se devo acrescentar o comando .~/.profile no próprio bashrc ou executá-lo no terminal( mas de qualquer forma eu o acrescentei na linha de comando do ~/.bashrc. Outra coisa,
em Note for sysadmins, quando entro no bash.bashrc e escrevo as mesmas linhas ele retorna a mensagem que não é permitido salvar e me pergunta se eu escrevi todos os comandos corretamente. Eu os escrevi.
Tentei executar o ARB pelo terminal mesmo assim e recebi a mensagem:
[root@localhost usuario]arb
usin ARBHOME='/usr/arb'
Directory /root/.arb_prop not found -creating ...
Directory /root/.arb_prop/macros not found -creating ...
Please wait while the program ARB is starting ...
[root@localhost usuario]#arb-ntree: error while loading shared libraries: libXm
ARB done
e nada mais acontece.
eu sei que ele precisa do perl5 e do treetool mas eu não encontro essas dependências em nenhum lugar. Já tentei o synptic e o yumex , mas não deu. E alguém sabe o qual é o problema com o libXm?