Editor de moléculas

mandyy
(usa Manjaro Linux)

Enviado em 09/04/2020 - 23:18h

Estou precisando de um editor de moléculas para Linux, antes de usar Linux eu usava o ArgusLab, mas ele só tem pra Windows

edjen
(usa Manjaro Linux)

Enviado em 10/04/2020 - 00:47h

# Molecular Workbench

# PyMOL

# Avogadro (advanced molecule editor, tem versão GIT)

# iqmol

#Blender (veja se existe algum script ou plugin)

Não é a minha área, procure por informações em outras distribuições, esses eu encontrei no Manjaro.
São atualizados. Mas no Arch linux certamente tem muita coisa.

Não sei se é exatamente o que você procura !
Boa sorte !

mandyy
(usa Manjaro Linux)

Enviado em 10/04/2020 - 03:13h

Estou tendo dificuldades ao instalar o Avogadro. Eu baixei o programa e veio uma pasta cheia de arquivos, um deles chamado INSTALL
Eu tentei rodar o INSTALL com o comando

./INSTALL 

,mas obtive isso:

./INSTALL: linha 1: Requirements: comando não encontrado
./INSTALL: linha 2: ============: comando não encontrado
./INSTALL: linha 3: erro de sintaxe próximo ao token inesperado `('
./INSTALL: linha 3: ` -- CMake 2.8.9 or later (2.8.11 recommended)'
 

RogerDez
(usa Outra)

Enviado em 10/04/2020 - 07:22h

não precisa fazer a instalação manual do avogadro..
mas é um programa com muitas dependências.

tem várias versões do avogadro no AUR
eu não vou sugerir um pacote específico, pq tem que ler a respeito
mas se for o 'avogadro' normalzão,

aur/avogadro 1.2.0-6 (+13 0.00%)
    An advanced molecular editor based on Qt 

mandyy
(usa Manjaro Linux)

Enviado em 10/04/2020 - 15:21h

Existem versões mais completas do Avogadro no AUR? Acho que pra mim seria melhor instalar a versão mais completona pq eu faço curso técnico em química, ent pode ser que eu precise de alguma função que não está disponível do Avogadro padrão

mandyy
(usa Manjaro Linux)

Enviado em 12/04/2020 - 01:12h

Eu tentei instalar o Avogadro mas apareceu esse erro:

-- Configuring incomplete, errors occurred!
See also "/var/tmp/pamac-build-amanda/avogadro/src/avogadro-1.2.0/build/CMakeFiles/CMakeOutput.log".
See also "/var/tmp/pamac-build-amanda/avogadro/src/avogadro-1.2.0/build/CMakeFiles/CMakeError.log".
==> ERRO: Uma falha ocorreu em build().
    Abortando...
 

RogerDez
(usa Outra)

Enviado em 12/04/2020 - 11:06h

se vc quiser, antes de ver os logs, pode tentar instalar o seguinte pacote do aur no lugar do pacote 'avogadro' e ver se ele instala:
avogadro-git
a versão avogadro-git é versão de desenvolvimento, mais recente e pode ser que consiga instalar..

ainda tem um tal de avogadro2-git com avogadrolibs-git , mas eu não conheço este programa não sei se é o que vc quer.

vai com calma. se o avogadro-git não der, passa os logs da instalação do primeiro pacote de 'avogadro' que vc tentou fazer (terá que tentar instalar ele de novo para gerar os logs).

no caso, vc precisaria mandar os logs para gente ver o que está ocorrendo.
logo depois que os erros ocorrerem, vc poderá pegar os logs em (de acordo com sua msg anterior),
/var/tmp/pamac-build-amanda/avogadro/src/avogadro-1.2.0/build/CMakeFiles/CMakeOutput.log
/var/tmp/pamac-build-amanda/avogadro/src/avogadro-1.2.0/build/CMakeFiles/CMakeError.log