Um sistema X Window muito utilizado nas distribuições Linux é a coleção de programas do Projeto XFree86 que é baseado na X11R6.4 ou X11, revisão 6.4.

O XFree86 é resultado do trabalho de vários programadores do Open Source e desenvolvedores ao redor do mundo. Uma das vantagens do XFree86 é que a maioria, senão todo o código fonte para os servidores, clientes, módulos, bibliotecas está disponível. Todavia o XFree86 não é distribuído sob a licença GLP, ele é protegido por um tipo de licença BSD de direito autoral, nem todo o código fonte tem que ser fornecido e os vendedores podem fazer melhorias porém distribuir apenas versões em binário.

O XFree86 funciona em uma quantidade bastante vasta de chips de vídeo, placas gráficas e sistemas para notebook, incluindo hardware não Intel. Porém, se você tiver uma necessidade especial ou o XFree86 não funcionar adequadamente, você pode usar fontes alternativas.

Posteriormente, a versão XFree86 da X.Org, baseado no X11R6.4 incluíram algumas melhorias como exibidores multi-head (XINERMA), recursos de configuração mais simples, Display Power Management Signal (DPMS) para economizar energia dos monitores, exigência de memória reduzida, APIs, novas placas gráficas suporte DRI para gráficos 3D etc.

As novas distribuições vem disponibilizando como X Window o XOrg e não mais o XFree86. O XOrg é um fork no projeto Xfree a partir da versão 4.4 Rc2. Essa mudança originou-se por causa da licença do Xfree4.4 final que impunha cláusulas de propaganda.

Basicamente, como o xfree é open source, ex-programadores do xfree, insatisfeitos com o desenvolvimento do mesmo, resolveram fazer um novo projeto baseado no xfree. Como o xfree mudou a sua licença, onde cada distro que a utilizasse ficaria obrigada a mencionar o uso do xfree em sua licença principal, algumas distros resolveram mudar para a XOrg, que utiliza a licença GNU/GPL tradicional.