Antes de tudo, verifique se a placa mãe do computador que será utilizado dá suporte ao boot por USB, acredito que essa dica é válida para qualquer distribuição Linux.

Há alguns dias que venho tentando instalar o Fedora 15 de forma funcional no HD Externo sem utilizar programas como UNetBootin, entre outros, até mesmo porque a minha intenção não era utilizar um sistema Live USB, mas sim um que me fizesse se sentir no meu Desktop, com todos os meus arquivos e programas no lugar independente do computador que eu usa-se. Estou falando de um dispositivo tão portável quanto um Smarthphone, pelo menos pra mim que tenho acesso a computadores aonde quer que eu vá, no trabalho, faculdade e em casa. Basta dar o boot.

Vamos lá, primeiro organize o seu ambiente:

1. Formate o seu HD externo, deixe-o sem identificação (espaço não alocado). Sugiro fazer isso com o GParted.

2. Baixe e grave a versão DVD do Fedora 15. Não tive sucesso com a versão Live CD.

3. Conecte seu HD Externo na placa mãe.

4. Insira o DVD do Fedora no drive.

5. Reinicie a máquina e dê boot pelo DVD normalmente.

6.Prossiga até se deparar com a "forma de instalação desejada", escolha o particionamento/instalação manual. Localize o espaço do seu HD Externo.

7 - Crie três partições da seguinte maneira (o segredo está aqui):

( /dev/sdb2 )
Sistema de arquivos: ext4
Ponto de montagem: /boot
Tamanho: 600Mb (opcional)
Flags: boot

Obs.: Essa é a partição bootável, observe o Ponto de montagem e o Flags (que é a opção "gerir parâmetros" no GParted).

( /dev/sdb3 ) Sistema de arquivos: swap
Ponto de montagem: não existe
Tamanho: 500Mb (opcional)

Obs.: Melhor prevenir do que remediar.

( /dev/sdb5 )
Sistema de arquivos: ext4
Ponto de montagem: /
Tamanho: 60GB (opcional)

Obs.: Essa é a partição onde o Fedora será instalado. Muito provavelmente, quando você der "Ok" pra criar essa última partição o SO colocará ela dentro de uma outra partição chamada "Extended"( /dev/sdb4 ). Não se preocupe, deixe assim mesmo.

Se quiser, o resto do HD que estará livre você pode formatar para NTFS, pois você pode precisar armazenar arquivos lá que serão acessados pelo Windows. Por exemplo, meus projetos do Eclipse IDE estão todos no NTFS e acesso direto do Fedora sem problemas, para que caso algum colega ou a professora queira ver os meus códigos (eles usam Windows). Até mesmo para o seu HD externo não perder a função de um HD externo.

8. Prosseguir com a instalação normalmente até finalizar.

9. Reinicie o computador, apertando F12 na inicialização (normalmente é essa tecla) selecione a opção USB-HDD. Porventura, aqui no meu Desktop (placa mãe Gigabyte) se eu selecionar a opção USB-HDD ele passa direto e entra no Windows, no entanto, eu entro na opção "Discos Rígidos" e lá está o meu HD Externo junto com o meu Seagate Interno.

10 - Faça login no seu Linux que está rodando pelo HD Externo e boas experiências!

Informações adicionais:

Dei boot em cerca de 10 computadores Dell entre eles os modelos Optiplex 330, 745 e 755, no meu Desktop de casa (placa mãe Gigabyte GA-EP43-DS3L), e em um notebook Dell Inspiron 1440. Os resultados deram 100%.

Meu HD Externo é um Samgung de 500Gb e eu escrevi e mandei essa dica pro VOL através dele. \o\O/o/

É isso aí!

Abraço!