Disk /dev/sda: 698,7 GiB, 750156374016 bytes, 1465149168 sectors
Units: sectors of 1 * 512 = 512 bytes
Sector size
(logical/physical): 512 bytes / 4096 bytes
I/O size (minimum/optimal): 4096 bytes / 4096 bytes
Disklabel type: dos
Disk identifier: 0xf03971ac
Device Boot Start End Sectors Size Id Type
/dev/sda1 2048 3999743 3997696 1,9G 82 Linux swap / Solaris
/dev/sda2 * 3999744 4999167 999424 488M 83 Linux
/dev/sda3
5001214 200309809 195308596 93,1G 5 Extended
/dev/sda4 200312832 1465149167 1264836336 603,1G 83 Linux
/dev/sda5 5001216 200309809 195308594 93,1G 83 Linux
Partition 3 does not start on physical sector boundary.
Partition table entries are not in disk order.
---
Repare nas partes em negrito. Seu HD usa setor FÍSICO de 4096 bytes mas o setor LÓGICO de 512 bytes.
O que significa que em cada setor físico servem 8 setores lógicos.
O fdisk dá essa mensagem porque a partição 3 começa em um setor (5001214) não divisível por 8, ou melhor, 5001214 setores vezes 512 bytes = 2560621568, não divisível por 4096.
Repare que a partição 1 (por exemplo) começa em um setor divisível por 8 (2048), ou 2048 x 512 = 1048576 / 4096 = 256, por isso o fdisk não "chia" por causa dessa partição.
Isso tem a POSSIBILIDADE de prejudicar o desempenho do HD, mas no meu HD também aparece essa mensagem e nunca senti problemas no desempenho. Nunca cheguei a fazer benchmark pra ver se realmente há perda de desempenho, mas como nunca senti nenhuma demora além do normal nas operações, deixei assim mesmo. Eu recomendo deixar o HD assim mesmo e só corrigir isso caso sinta perda de desempenho.
Pra corrigir isso você terá que "arrastar" o início da partição 3 para um setor que seja divisível por 8. Pode usar o fdisk mesmo para isso.
OBS: a tag [c.ode] se usa sem o ponto. Eu só coloquei o ponto porque senão o editor de texto o interpretaria como uma tag e você não iria visualizá-lo.
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
admin@server:~$ whatis life
life: nothing appropriate