Permissoes no Modo Gráfico

Olá, estou com o seguinte problema:
Em /opt/iReport3.0.0/bin setei permissoes totais rwx e alterei o proprietario para meu usuario a questao é que via console consigo manipular a pasta normalmente mas no modo gráfico não consigo nem visualizar o conteúdo desta pasta bin, que tipo de permissao devo atribuir para poder acessar/ler/salvar esta pasta no modo grafico?
Obrigado Renato

Faça o seguinte:

Logue-se no modo gráfico entre como root:

Feito isso você decida ai contigo , não sei se é um dektop onde esta fazendo isso, ou mesmo uma estação ed trabalho então você tem que saber quais são as prioridades, se fosse em ksa e não tivesse o perigpo de ninguem mecher eu vinha e fazia assim:

Como root:

# chmod u=rwx,g=rwx,o=---