Conectar aplicação php no mysql

Recomendo que vc atentamente leia o artigo:
http://www.vivaolinux.com.br/artigo/PDO-Introducao-e-conceitos/
Leia por várias vezes e quando ver que já o entende poderá usar esse recurso que resolverá os teus problemas.
Sou desenvolvedor PHP em uma repartição pública e usamos esse recurso.
Pode até existir outros melhores porém no momento só sei te indicar esse.

Paulo
henbran@hotmail.com
Guarulhos - SP